הקרן פועלת על פי נוהל תמיכות פומבי ושיוויוני המתקיים במסגרת מועדי ההגשה המתפרסמים מבעוד מועד והמיועדים לציבור בכפוף לקריטריונים מקצועיים. דפוסי עבודה אלו תואמים את גישתה של הקרן הדוגלת בחופש היצירה והביטוי, בפלורליזם ובמתן ביטוי למיגוון התרבותי של החברה בישראל.

הקרן פועלת לשיתוף פעולה בינלאומי בהפקות סרטים ביחד עם קרנות קולנוע ברחבי העולם.
לאחרונה חתמה הקרן על הסכם שיתוף פעולה בתחום פיתוח תסריטים ובתחום השיווק וההפצה עם הקרן של מדינה נורד-ריין-וסטפליה בגרמניה.

הקרן מיסודו של משרד החינוך, התרבות והספורט פועלת עפ"י המדיניות, ההמלצות וההחלטות של המועצה הישראלית לקולנוע.